Se disputara en dos etapas denominadas Apertura y Clausura.

Torneo Apertura:

Se jugará por el sistema de todos contra todos, en una rueda de partidos, local y visitante, por puntos.

Torneo Clausura:

Se jugará por el sistema de todos contra todos, en una rueda de partidos, por puntos, iniciándose con puntaje "cero" para cada club participante, y la condición de local y visitante para cada uno de ellos será inversa a la que los participantes tuvieron en oportunidad de enfrentarse en el Torneo "Apertura".

Campeon primera D torneo 2005/2006:

1) Si el ganador de los Torneos "Apertura" y "Clausura" fuera un mismo club, resultará el campeón, y adquirirá el derecho de ascender a la Primera Categoría "C", a partir de la temporada 2006/2007.
2) Si los ganadores de los Torneos "Apertura" y "Clausura" fueran clubes distintos, se enfrentaran entre sí, a doble partido, local y visitante, actuando como visitante en el primer partido, el equipo que hubiera obtenido mejor ubicación en la Tabla Final de Posiciones 2005/2006.

Si al término del segundo partido, la cantidad de puntos y la diferencia de gol resultaran igualadas, se jugará un tiempo suplementario de treinta minutos, en dos períodos de quince minutos cada uno, y de subsistir la igualdad, la definición se operará mediante la ejecución de tiros desde el punto penal.
El ganador, será quien adquirirá el derecho de ascender a la Primera Categoría "C", donde participará en la temporada 2006/2007.

Promocion con la Primera C:

De producirse el supuesto señalado en el Punto 1, la Promoción con la Primera División "C" será disputada por el ganador de un Torneo "Reducido", en el que habrán de intervenir los cinco equipos mejor ubicados en la Tabla Final de Posiciones 2005/2006, excluido el ascendido, y de acuerdo a la siguiente disposición:
El primero de los cinco equipos aguarda la confrontación entre los cuatro restantes, los cuales se enfrentarán de la siguiente manera: segundo-quinto y tercero-cuarto. Los dos ganadores jugarán entre sí, para determinar aquel que habrá de enfrentarse con el equipo mejor ubicado en la Tabla Final de Posiciones, determinándose así el ganador del Torneo" Reducido".
Todas las instancias se jugarán a doble partido, actuando como local en el segundo de ellos el mejor ubicado en la Tabla Final de Posiciones, y si al término del segundo partido, la cantidad de puntos y la diferencia de gol resultaran igualadas, se jugará un tiempo suplementario de treinta minutos, en dos períodos de quince minutos cada uno, y de subsistir la igualdad, la definición se operará mediante la ejecución de tiros desde el punto penal.

Si se dieran las circunstancias mencionadas en el Punto 2, el Torneo "Reducido" lo disputarán los cuatro equipos mejor ubicados en la Tabla Final de Posiciones, excluidos los ganadores de los Torneos "Apertura" y "Clausura", de acuerdo a la siguiente disposición: primero-cuarto y segundo-tercero.
Los dos ganadores jugarán entre sí, y el equipo que resultara vencedor se enfrentará con el perdedor de la final por el ascenso directo, determinándose así el ganador del Torneo "Reducido".
Todas las instancias se jugarán a doble partido, siendo local en el segundo de ellos el equipo mejor ubicado en la Tabla Final de Posiciones; y si al término del segundo partido, la cantidad de puntos y la diferencia de gol resultaran igualadas, se jugará un tiempo suplementario de treinta minutos, en dos períodos de quince minutos cada uno, y de subsistir la igualdad, la definición se operará mediante la ejecución de tiros desde el punto penal.

La Promoción con la Primera División "C" se jugará a doble partido, local y visitante, el primero de ellos en el estadio del club de Primera "D".
Si al término del segundo partido, la cantidad de puntos y la diferencia de gol resultaran igualadas, el equipo de Primera "C" mantendrá la Categoría.

Desafiliación por promedio:

La desafiliación por promedio sera para quel equipo que obtenga el promedio mas bajo tendiendo en cuenta los Campeonatos de Primera División "D" correspondientes a las temporadas 2003/2004, 2004/2005 y 2005/2006. Este equipo perdera la categoría por un año.
Si al término del Campeonato de Primera División "D" 2005/2006 dos o más equipos igualaran el promedio mas bajo se debera recurrir a la realización de partido/s de desempate.

El equipo que hubiera perdido la afiliación en forma temporaria, no podrá disputar instancias que impliquen el ascenso o promoción con la Categoría Primera "C". Su lugar será ocupado por el club que obtuvo la posición siguiente en la Tabla Final de Posiciones.

Todas las instancias se jugarán a doble partido, siendo local en el segundo de ellos el equipo mejor ubicado en la Tabla Final de Posiciones; y si al término del segundo partido, la cantidad de puntos y la diferencia de gol resultaran igualadas, se jugará un tiempo suplementario de treinta minutos, en dos períodos de quince minutos cada uno, y de subsistir la igualdad, la definición se operará mediante la ejecución de tiros desde el punto penal.